Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC006065.6-201ENST00000625201 545 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.72□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.71□□□□□ -1.49
PTPRCP08575 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 AL137100.1-201ENST00000556703 1620 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 UBE3A-203ENST00000428984 2986 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 RNU6-819P-201ENST00000364116 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 AL050305.1-201ENST00000399993 1230 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 RPS12P10-201ENST00000427031 377 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 CEACAMP9-201ENST00000442990 513 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 PRKACB-213ENST00000446538 1112 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 TTTY23B-202ENST00000451467 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 TTTY23-201ENST00000452889 512 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 AC096586.2-201ENST00000610260 441 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 AC012361.1-201ENST00000447260 1498 ntTSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 GBA3-205ENST00000511446 2018 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 OFD1P8Y-201ENST00000449148 1433 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 ARHGAP42-203ENST00000524892 5685 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 ARL4A-205ENST00000404894 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 TRBV8-1-201ENST00000481590 279 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 MTERF3-205ENST00000524341 776 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 AC010201.1-201ENST00000605051 540 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 AC005014.3-201ENST00000605985 190 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 NXPH1-205ENST00000602349 1953 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 MRRF-208ENST00000394315 1501 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 FAM26D-202ENST00000368597 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 MAP3K19-201ENST00000358371 3719 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 TRPC4-205ENST00000379679 2475 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 OR8H3-201ENST00000313472 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 TCEANC-201ENST00000380600 2988 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
PTPRCP08575 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms