Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC027309.1-201ENST00000519976 528 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 SLC2A13P1-201ENST00000531560 322 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC135050.4-201ENST00000568708 504 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC117569.1-201ENST00000584482 739 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC010320.2-203ENST00000601745 574 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 SNHG8-202ENST00000602483 309 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL953862.2-201ENST00000603089 820 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL161457.2-204ENST00000609241 869 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 PPP3CB-AS1-213ENST00000620302 501 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 TRIM34-204ENST00000514226 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 CXCL8-201ENST00000307407 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC015689.2-201ENST00000528172 1738 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC062022.1-201ENST00000451026 1684 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC022034.1-201ENST00000512867 2156 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 FBXO3-213ENST00000534136 3217 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 ROR1-204ENST00000545203 5362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 PIK3C2A-201ENST00000265970 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 VEPH1-202ENST00000392832 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 KLHL41-201ENST00000284669 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
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HOXA3O43365 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 GYPA-214ENST00000641688 1764 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 OR4N2-201ENST00000315947 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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HOXA3O43365 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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HOXA3O43365 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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HOXA3O43365 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC016813.1-201ENST00000521511 735 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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HOXA3O43365 AC012038.2-201ENST00000553006 256 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AL049875.1-202ENST00000556620 857 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 JKAMP-212ENST00000556985 592 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
HOXA3O43365 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
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