Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

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Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CEP290O15078 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CEP290O15078 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CEP290O15078 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CEP290O15078 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CEP290O15078 AC078828.1-201ENST00000471993 458 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CEP290O15078 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CEP290O15078 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CEP290O15078 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CEP290O15078 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CEP290O15078 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CEP290O15078 OPRM1-217ENST00000522236 2459 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CEP290O15078 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CEP290O15078 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CEP290O15078 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CEP290O15078 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CEP290O15078 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CEP290O15078 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CEP290O15078 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CEP290O15078 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CEP290O15078 OR2M5-201ENST00000366476 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CEP290O15078 AC009478.1-201ENST00000429816 562 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CEP290O15078 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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CEP290O15078 LINC01923-201ENST00000443261 592 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CEP290O15078 AC104306.1-201ENST00000449702 371 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CEP290O15078 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CEP290O15078 SPTSSB-202ENST00000497137 880 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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CEP290O15078 AC046130.2-201ENST00000537655 794 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CEP290O15078 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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CEP290O15078 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CEP290O15078 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CEP290O15078 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CEP290O15078 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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CEP290O15078 NHSL2-204ENST00000631375 12593 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
CEP290O15078 ZNF432-202ENST00000594154 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
CEP290O15078 LINC01204-202ENST00000435394 2214 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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CEP290O15078 HYDIN-201ENST00000288168 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
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CEP290O15078 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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CEP290O15078 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
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CEP290O15078 LGSN-202ENST00000370658 5213 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CEP290O15078 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
CEP290O15078 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
CEP290O15078 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
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