Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 TRAV10-201ENST00000390432 379 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC138761.5-201ENST00000433967 325 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC245427.2-201ENST00000438839 263 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC006326.1-201ENST00000445465 787 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC048351.1-202ENST00000449483 735 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC093248.1-201ENST00000513197 417 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC111000.6-201ENST00000514471 709 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 IGKV1-32-201ENST00000519290 311 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AP003557.1-201ENST00000531715 585 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 LINC02410-201ENST00000553095 393 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC011507.1-201ENST00000585364 567 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC015802.3-201ENST00000590241 570 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 APOC2-203ENST00000590360 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 GXYLT1P5-202ENST00000618830 589 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 ASAH2-202ENST00000395526 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 DNAH8-201ENST00000327475 14360 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 EXPH5-201ENST00000265843 10187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 EIF1AY-201ENST00000361365 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AL355488.2-201ENST00000609909 2850 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 NSD1-202ENST00000354179 12195 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 COMMD6-204ENST00000377619 594 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 SNORA66-201ENST00000384792 133 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 RPS26P4-201ENST00000431743 355 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AL049552.1-201ENST00000444302 577 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC010149.1-201ENST00000455357 571 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC087071.2-201ENST00000483283 575 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
C4orf47A7E2U8 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms