Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 OR13C3-201ENST00000374781 1108 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AL596448.1-201ENST00000415024 392 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AL139008.2-201ENST00000420315 395 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 GLUD1P9-201ENST00000420997 1173 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 SLC9B1P4-201ENST00000421957 1288 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AL354714.4-201ENST00000427339 575 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AL365220.1-201ENST00000432923 399 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 FMO7P-201ENST00000436045 768 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 RPS27P5-201ENST00000444247 244 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AL450996.1-201ENST00000445574 1202 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 OSTCP1-201ENST00000455507 450 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 SPRR2F-201ENST00000468739 681 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC004815.1-201ENST00000484185 331 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 SUMO1P1-201ENST00000497904 306 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 SERF1B-203ENST00000503931 569 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 SERF1A-204ENST00000504458 569 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC091860.2-201ENST00000509423 941 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 RNU5A-4P-201ENST00000516588 111 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 RAD21-204ENST00000518055 896 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AP003969.1-201ENST00000531846 400 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 DCN-210ENST00000547568 823 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AGGF1P7-201ENST00000562369 913 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC096996.1-201ENST00000563813 325 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 RBM22P1-201ENST00000578589 1214 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AL137078.2-201ENST00000615740 318 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 DARS-AS1-227ENST00000627442 633 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 OR13C3-202ENST00000641090 1108 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 PSMA4-201ENST00000044462 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC089984.1-201ENST00000552780 1431 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AF130351.1-202ENST00000400562 808 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 VN1R31P-201ENST00000417498 730 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 EIF4A1P1-201ENST00000420241 934 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01740-201ENST00000423842 332 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM60P9Y-201ENST00000438459 816 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 TRIM60P11Y-201ENST00000445313 801 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 EIF4A1P6-201ENST00000448133 1210 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00704-203ENST00000449712 703 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 OTX2P1-201ENST00000450956 354 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 PLCE1-AS2-205ENST00000453183 427 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC092754.2-201ENST00000463506 460 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC006539.1-201ENST00000481419 501 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP360-201ENST00000516555 118 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 POLR2K-203ENST00000522439 543 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
SH3BP1Q9Y3L3 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.2 ms