Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 ATP1B4-202ENST00000361319 3856 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 KIF2A-203ENST00000407818 2315 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 SGO1-202ENST00000306698 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 C1orf112-201ENST00000286031 4355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 DPH5-204ENST00000427040 609 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC079760.2-201ENST00000449361 681 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 LINC02466-202ENST00000509105 653 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AL161757.4-204ENST00000557136 834 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC011447.4-201ENST00000587562 111 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC243829.4-201ENST00000620056 701 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC139792.2-201ENST00000624218 587 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CIPCQ9C0C6 AL078595.2-201ENST00000605309 1780 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 FHL1-218ENST00000543669 2878 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 OR1L8-201ENST00000304865 1061 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 R3HCC1L-204ENST00000370586 941 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 RNU6-636P-201ENST00000384598 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 OR8V1P-201ENST00000395193 873 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 CHMP1B2P-201ENST00000399581 597 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 HMGB1P13-201ENST00000406019 642 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CIPCQ9C0C6 LRRC70-203ENST00000491184 703 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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