Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
LRIG3Q6UXM1 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
LRIG3Q6UXM1 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.57
LRIG3Q6UXM1 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AL359636.2-201ENST00000412262 259 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 PA2G4P6-201ENST00000438325 1197 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 RPL7L1P1-201ENST00000448259 785 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 SNORD11.1-201ENST00000459482 85 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AC010627.1-201ENST00000503819 1294 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 LINC02428-201ENST00000508099 527 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 TCP11X3P-202ENST00000514289 1254 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 IGHVIII-2-1-201ENST00000518843 291 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 NRBF2P4-201ENST00000520874 850 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AC073023.1-201ENST00000522896 773 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 OR10V3P-201ENST00000525712 725 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AC006206.2-202ENST00000537714 648 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AC025419.1-207ENST00000546198 1072 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AC079950.1-201ENST00000551229 568 ntTSL 4 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AC004232.3-201ENST00000622977 525 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 SATB1-AS1-259ENST00000629477 853 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 DARS-AS1-230ENST00000631306 530 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AC083843.2-201ENST00000568248 6253 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 MFSD8-220ENST00000641243 1422 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AC021242.1-201ENST00000507315 2035 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 ODAM-201ENST00000396094 1319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 HSPD1P11-201ENST00000508643 1702 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 PPBP-201ENST00000296028 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 ATP5HP3-201ENST00000396994 486 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AL034403.1-201ENST00000399414 885 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 RPL34P3-201ENST00000421454 338 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 EIF4HP2-201ENST00000424380 563 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AC092648.1-201ENST00000425870 423 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 Z82198.2-201ENST00000434741 567 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 MLIP-IT1-201ENST00000441845 643 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 Z77249.1-201ENST00000444622 1175 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AC006482.1-201ENST00000448898 273 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 IGHVII-60-1-201ENST00000519079 256 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AC011595.3-201ENST00000546699 632 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
LRIG3Q6UXM1 AC087301.1-201ENST00000579037 321 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms