Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC006504.7-201ENST00000592806 924 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 LINC00284-211ENST00000620454 534 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC135068.2-201ENST00000622410 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 CDC16-202ENST00000252458 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC007491.1-202ENST00000637961 1576 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 COA1-201ENST00000223336 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC093159.1-201ENST00000416845 424 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC093763.2-201ENST00000505334 1223 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC024132.2-201ENST00000506878 482 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC087783.1-201ENST00000527135 564 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 LINC02446-201ENST00000544591 868 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 TTN-AS1-237ENST00000590743 812 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AL445222.1-201ENST00000607259 628 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AP000894.4-201ENST00000610185 483 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 KRTAP24-1-201ENST00000340345 1650 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 PLET1-201ENST00000338832 1215 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 RNA5SP507-201ENST00000363603 121 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 RN7SKP167-201ENST00000411047 285 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
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CUL1Q13616 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC002378.1-201ENST00000432360 298 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AL139121.1-201ENST00000445647 244 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AL355613.1-201ENST00000451856 480 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 SKINT1L-203ENST00000453388 749 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 PGBD4P4-201ENST00000509673 613 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC100802.1-201ENST00000519197 1026 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC090312.1-201ENST00000580637 348 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC023762.1-201ENST00000603280 584 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC007497.1-201ENST00000610421 561 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 EIF3FP1-201ENST00000613970 806 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC048338.2-201ENST00000623601 684 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.81□□□□□ -1.64
CUL1Q13616 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
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