Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Top3bQ9Z321 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Top3bQ9Z321 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms