Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Pdpk1Q9Z2A0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Pdpk1Q9Z2A0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Pdpk1Q9Z2A0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Pdpk1Q9Z2A0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Pdpk1Q9Z2A0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Pdpk1Q9Z2A0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Pdpk1Q9Z2A0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
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Pdpk1Q9Z2A0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Pdpk1Q9Z2A0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdpk1Q9Z2A0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pdpk1Q9Z2A0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Pdpk1Q9Z2A0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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