Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X4

Ilf3, Interleukin enhancer-binding factor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ilf3Q9Z1X4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ilf3Q9Z1X4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ilf3Q9Z1X4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms