Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cacna2d3Q9Z1L5 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms