Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Shcbp1Q9Z179 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Shcbp1Q9Z179 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms