Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cldn3Q9Z0G9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms