Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU22

Ptpn4, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 4, mousemouse

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn4Q9WU22 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ptpn4Q9WU22 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ptpn4Q9WU22 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms