Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sema6cQ9WTM3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Sema6cQ9WTM3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms