Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Copg1Q9QZE5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms