Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY39

Pdzd4, PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd4Q9QY39 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Pdzd4Q9QY39 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Pdzd4Q9QY39 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms