Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Pkd2l2Q9JLG4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pkd2l2Q9JLG4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms