Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Irx5Q9JKQ4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Gm11361-201ENSMUST00000223428 607 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Irx5Q9JKQ4 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms