Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Smpd3Q9JJY3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms