Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJU9

Crybb3, Beta-crystallin B3, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crybb3Q9JJU9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crybb3Q9JJU9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crybb3Q9JJU9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crybb3Q9JJU9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crybb3Q9JJU9 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crybb3Q9JJU9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crybb3Q9JJU9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crybb3Q9JJU9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crybb3Q9JJU9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crybb3Q9JJU9 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Crybb3Q9JJU9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Crybb3Q9JJU9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms