Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ccdc86Q9JJ89 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc86Q9JJ89 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms