Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim2Q9ESN6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim2Q9ESN6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim2Q9ESN6 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms