Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES70

Nek6, Serine/threonine-protein kinase Nek6, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek6Q9ES70 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Nek6Q9ES70 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms