Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERR7

Selenof, Selenoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenofQ9ERR7 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
SelenofQ9ERR7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
SelenofQ9ERR7 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms