Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU5

Tnfrsf21, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 21, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tnfrsf21Q9EPU5 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tnfrsf21Q9EPU5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.5 ms