Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9V4

Rsph9, Radial spoke head protein 9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph9Q9D9V4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rsph9Q9D9V4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rsph9Q9D9V4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms