Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Snx5Q9D8U8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms