Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S1

Tmem54, Transmembrane protein 54, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem54Q9D7S1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Tmem54Q9D7S1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Tmem54Q9D7S1 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Tmem54Q9D7S1 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tmem54Q9D7S1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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