Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6W8

Borcs6, BLOC-1-related complex subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs6Q9D6W8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Borcs6Q9D6W8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Borcs6Q9D6W8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Borcs6Q9D6W8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Borcs6Q9D6W8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Borcs6Q9D6W8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Borcs6Q9D6W8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Borcs6Q9D6W8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Borcs6Q9D6W8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Borcs6Q9D6W8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Borcs6Q9D6W8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Borcs6Q9D6W8 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Borcs6Q9D6W8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Borcs6Q9D6W8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Borcs6Q9D6W8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Borcs6Q9D6W8 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Borcs6Q9D6W8 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Borcs6Q9D6W8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Borcs6Q9D6W8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Borcs6Q9D6W8 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Borcs6Q9D6W8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Borcs6Q9D6W8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Borcs6Q9D6W8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms