Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PudpQ9D5U5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms