Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Efhd1Q9D4J1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efhd1Q9D4J1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms