Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rsph14Q9D3W1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rsph14Q9D3W1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms