Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Pus10Q9D3U0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.46■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Pus10Q9D3U0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms