Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Spns3Q9D232 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Spns3Q9D232 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms