Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Rab3bQ9CZT8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms