Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Snx7Q9CY18 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Snx7Q9CY18 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms