Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
RpainQ9CWY9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RpainQ9CWY9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms