Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR40

Klhl28, Kelch-like protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl28Q9CR40 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Klhl28Q9CR40 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klhl28Q9CR40 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms