Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR02

Tma16, Translation machinery-associated protein 16, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tma16Q9CR02 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tma16Q9CR02 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tma16Q9CR02 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms