Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Atp5f1Q9CQQ7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Atp5f1Q9CQQ7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms