Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQF4 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQF4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQF4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Q9CQF4 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQF4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQF4 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQF4 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Q9CQF4 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9CQF4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9CQF4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9CQF4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Q9CQF4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQF4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQF4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQF4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQF4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQF4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQF4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQF4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQF4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQF4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQF4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQF4 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQF4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQF4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQF4 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQF4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQF4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQF4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQF4 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQF4 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CQF4 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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