Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
StambpQ9CQ26 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
StambpQ9CQ26 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms