Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Commd4Q9CQ02 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Commd4Q9CQ02 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms