Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPS8

Small membrane A-kinase anchor protein, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CPS8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CPS8 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CPS8 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CPS8 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CPS8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CPS8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9CPS8 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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