Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Krt88Q9CPR6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Krt88Q9CPR6 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Krt88Q9CPR6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms