Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rnf17Q99MV7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rnf17Q99MV7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms