Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rnf34Q99KR6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rnf34Q99KR6 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms