Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Usp11Q99K46 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Usp11Q99K46 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms